DNA鉴定实验室是工作人员进行日常检验的场所，实验室的合理安排及相关区域的仪器设备配置是获得科学、准确结果的必要保证。DNA实验室的组建要求科学合理，充分考虑DNA检验的特点，尤其要注意避免检材DNA的交叉污染以及外源DNA的污染。标准规范的DNA实验室应包括以下几个区域：
1. 样品处理区：本区域主要用来进行各种检材的照相、初检、镜检。应具备普通离心机、显微镜、水浴箱、烤箱等基本设备。
2. DNA提取区：本区域主要用来提取各种检材的DNA，并对提取的DNA数量及质量进行检测。应具备台式高速离心机（室温及冷冻）、漩涡振荡器、干热器、反转摇床、恒温水浴箱、磁力搅拌器、潜水式凝胶电泳装置、微量移液器等。
3. PCR扩增区：本区域主要用来进行PCR反应加样和扩增，加样应在隔离的超净工作台内进行。应具备超净工作台、漩涡振荡器、小型台式离心机、制冰机、微量移液器（一套）、PCR试剂专用冰箱、PCR扩增仪等设备。
4. 检测区：本区域主要用来进行扩增产物的确认和产物的分离及判断型。应具备电泳装置、DNA片段显现装置、微量移液器（一套）、扩增产物专用冰箱。
此外，主要用于DNA检测的暗室应具备投射紫外观察灯、照相及显像装置。试剂装置、消耗品存放、超纯水装置、数据处理装置应有单独空间。如实验室还进行其他DNA项目的检验，应在上述区域以外另行配备。
如实验室条件有限，检材的前处理、DNA的提取、PCR扩增、产物的分析可在同一房间内严格划区来实施。
