在亲子鉴定的结论描述中提示有“在排除外源干扰”的情况下，给出鉴定意见。这里外源干扰通常指采集的口腔拭子和血痕样本是否有外源干扰，确认采集的吃母乳的小孩口腔拭子需要在吃母乳半小时后采集，防止母乳在小孩嘴里混入到口腔拭子样本里面；确认采集血痕样本留样者近期未收受过输血和骨髓移植，防止外源血液和再造血液对本体血液的遗传基因的影响。
亲子鉴定结论排除外源干扰是严谨的标准，大概率不会影响结果。
亲子鉴定结论排除外源干扰，一般不管在采集样本的时候是否存在外源干扰的情况，都会严谨的写进结论描述里面。因为，存在的外绕干扰一般都是在采集样本的时候，采集人员或收样人员仅对留样者的口头确认，来保证采集合格的样本。在这里的排除外源干扰，一般认为是采集口腔拭子的时候，如采集吃母乳的小孩，需要吃完母乳半小时后采集口腔拭子，以防孩子嘴里的母乳混入到采集口腔拭子的样本中；或是输血或干细胞移植造成的外源干扰。这两种情况的外源干扰可能导致所取的样本混入非本体的细胞，导致对样本的DNA检测不准确。但是对样本的采集，其主要是采集到的是本体的细胞，外源细胞若有部分，可能造成是所采集的样本DNA检测得到是混合DNA的结果。可能检测的仅外源个体的DNA信息的可能性是很小的。
亲子鉴定外源干扰需要结合样本的检测的结果来分析样本是否存在外源污染。
外源干扰一般都是因此所采集的样本可能存在其他个体的细胞污染，这些外源的细胞一般是微量的，是否对样本存在影响，是不得而知的。需要通过对样本的DNA检测才能确认是否存在污染，如果检测出来是单个个体的时候，那个污染可能是不存在的，那么检测出来的个体DNA信息是否是所需要测的个体的DNA信息，还是外源的个体的DNA信息呢？这个得需要和当事人的亲子鉴定结果来分析，如做母子鉴定，母亲存在输血的情况，而采集母亲的样本又不得不采集血痕的时候，对母亲所采集的血痕进行DNA检测，得到单个的DNA分型和孩子比对存在亲子关系的时候，在确保外源输血非亲属的情况下，可以断定所测的母亲血痕的样本的DNA信息肯定就是母亲本人的了。
因此，亲子鉴定对所测的样本可能存在外源干扰的情况下，多检测结果大概率是准确的，外源干扰的情况概率小。也就是外源干扰一般是不影响亲子鉴定结果，只是有可能影响亲子鉴定结果。
