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DNA鉴定之SNP分型方法和技术

      认识到SNP对司法鉴定的重要性,国内外学者纷纷把目光集中到SNP研究  上(Tomas et a1.,2008; Sanchez et a1.,2008; Amigo et a1.,2008)。目前国外  研究人员已经纷纷开始大规模选定相关SNP并进行人群频率分布调查,从而为  相关应用奠定基础(Lessig et a1.,2005; Sanchez et a1.,2005; Brion et al., 2005;Coble et a1.,2004;Vallone et al.,2004)。欧洲甚至三专专门机构(The SNPforID Consortium)从法医学角度对全基因组SNP在世界夏要内人群分布频率进行调查研究(Parson et a1.,2008;Bouakaze et a1.,2007):在我国,也有少数研究人员进行了此类工作,但是与国外相比,国内整体步伐明显落雪.投入偏少。

      国外研究现状:国外所研究的SNP数目多,人群分布广,研究人员多.论文多。例如,Kidd等(2006)对常染色体上19个SNP的研究,Vallone等(2005)对常染色体上70个SNP的研究,Lee等(2005)对全基因组24个SNP在韩国人群中分布频率的研究,Dixon等(2006)对常染色体上20个SNP的研究,Phillips等(2006)对常染色体上32个SNP的研究,Sanchez等(2006)对常染色体上52个SNP的研究等。这些研究中所用的SNP分型方法各异,如Vallone、Lee和Sanchez等大部分研究者使用的是MiniSequencing方法,以SNaPshotTM试剂盒对SNP进行分型;Kidd筹使用TaqMan技术;Dixon等使用扩增阻碍突变系统(amplification refractory mutation system,ARMS)和通用报告引物(universal reporter primer,URP)法。与传统的限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,RFLP)等方法相比,这些方法结果都比较稳定,并且可以实现高通量检测。
      国内研究现状:国内已经有少数研究人员开始选定相关SNP并进行人群频率分布调查。例如,李莉等(2005)以多重PCR和芯片杂交的方法对31个SNP进行分型研究,杜宏等(2006)以微测序技术对12个Y-SNP及其群体遗传学的研究,Hou等(2006)用MALDI-TOF质谱分析法对Y染色体SNP的研究,以及叶健等( 2001)、王保捷等(2002)有关Y染色体SNP的报道、许传超等 (2003)有关线粒体SNP的报道等。其中,有关Y染色体SNP、线粒体DNA等的研究报道较多,对常染色体SNP的研究相对较少。
      在研究方法上,国内外既有应用芯片杂交或微测序法的研究,也有以MAL-DI- TOF质谱分析法进行剡型的方法,还有以限制酶酶切结果或改良PCR判定SNP型别的报道。近几年来,随着对SNP基因分型商业前景的看好及巨额资金的投入,由国际上一些实力雄厚的公司研制开发出的高通量SNP分型系统逐渐问世并得到了普遍认同。下面将对近几年来出现的SNP分型技术进行综述。
 
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