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北京科鉴基因亲子鉴定中心之基因芯片

      DNA芯片在法医学检测中已有成功应用,因而DNA甲基化检测芯片同样具有一走的法医学应用前景。这包括用于整个基因组范围内扫描的差异甲基化杂交和用于检测已知特定CpG位点的甲基化特异性微阵列。最近美国Illumina公司所开发的用于全基因组DNA甲基化扫描的光纤微珠芯片(Infinium@ Human-Methylation27)即属于后者。此芯片的基本原理是通过重亚硫酸盐对模板DNA进行转化后,通过单碱基延伸对特定CpG位点进行甲基化状态检测。该芯片可同时对人基因组DNA 14 495个基因上已细煎27578个CpG位点的甲基化状态 进行扫描,并已应用于多项表观遗传学研究,获得了可靠的研究成果(Irizarry et a1.,2008)。另外,Illumina公司还可依据GoldenGate策略对多达1536个CpG位点进行微珠芯片定制。通过此工具有望筇选出可用于法医学鉴定的DNA甲基化位点。

      除上述方法外,位点特异性的DNA甲基化分析还有很多方法,如甲基化敏感性限制性内切核酸酶一PCR (methvianon-sensitive restriction endonuclease-PCR,MSRE-PCR)、重亚硫酸盐联合限剖性内切核酸酶分析(combined bisul-fite restriction analysis,COBRA)、甲基化敏感性解链曲线分析( methylation。specific melting curve analysis, MS-MCA)及甲基化敏感性单链构象分析 (methylation-specific single-strand conformation analysis, MS-SSCA)等,这些方法在一些甲基化方法综述中已有较为详细昀描述。但这些方法由于本身敏感性及自动化程度不高等原因,可能不适合在法医遗传学实验室常规开展。
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