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DNA鉴定之插入缺失多态性遗传标记的应用前景

    STR基因座的高突变率这一缺陷促使法医物证工作者致力于寻找更为稳定的遗传标记。lnDel作为一种特殊的二态性遗传标记,与单核苷酸多态性(sin-gIe  nucIeotide  PoIym0rphiSmSNP)具有相近的自然突变率,其突变率显著低于STR。同时,InDel  的两个人等位基因表现为片段长度多态性,这又与STR的等位基因的特征类似,使其可以采用目前法医DNA鉴定领域常用的复合荧光多重  PCR  联合毛细管电泳分型技术进行分型捡测,因而成为法医 DNA  鉴定关注的热点。在本节介绍的  InDel研究中,通过全基因组浏览器这一有效的人类基因扫描工具,筛选获得了  30  个散布于  22  条常染色体上、互不连锁的  InDeI  位点,并以此为基础联合Ame|ogenin基因座上的性别鉴定位点,采用复合荧光多重PCR技术建立了包含 30  InDe|位点和1个性别位点的多重  PCR  体系——In-DeI-typer30,并建立了相应的GeneMapper V3.2软件的分折方法,从而组合成了一套切实可行的法医  NA  鉴定工具。实际应用表明,InDeI_typer30  系统的分型是准确的。在中国汉族、回族、维吾尔族、蒙古族、藏族个民族中进行的遗传多态性的调查也表明,这  30    InDel  位点在上述 5 个民族中的平均期望杂合度分别达到了  0.4640.4600.4530.4660.469,平均个体识别效能分别达到了0.5950.5850.5860.5890.595,而CDP  值分别达到了0.999  999  999  998  410.999  999  999  996  900.999  999  999  997  090.999  999  999  997  720.999  999  999  998  54。这也表明  InDe|-typer30  系统对于中国这  5  个主要民族,无论是进行亲权鉴定或是个体识别均是一个有效的工具。己有研究表明,在一个达到遗传平衡的理想群体,对于二等位基因遗传标记,如 SNPInDe|  等,当其最低等位基囚频率达到  0.500  时,其个体识别效能达到最高。3个这样的位点其  CDP  可达到 0.947,这一  CDP  值相当于1个目前个体识别常用  STR  基因座的  DP  值。因此,可以推测  lnDe|_typer30  系统的CDP 值近似于  12  个常用  STR  基因座的   CDP。需要注意的是,在该系统中所有  InDe|  位点的圹增子长度均小于  260bp,这虽然成为限制这一系统所包含的  InDe|位点数的因素之一,但同时也成为这一系统的一个优势,使其具备了应用于降解DNA检材的潜能。

    InDe|_typer30  系统的不足之处在于所包含的位点数仍不够多,而采用诸如InDel这样的二等位基因遗传标记进行法医学DNA鉴定所面临的共同难点之一是需要的位点数较多。如前所述,要达到与目前法医DNA鉴定中常用的商业STR分型试剂盒(Sinofiler系统)同等个体识别效能约需要60个这样的位点,这将显著增加相应多重PCR扩增体系构建的难度。但显然,InDel_typer30系统的出现已为InDel标记在中国人群中的应用奠定了一定的基础。

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