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DNA亲子鉴定-共有基因座数和共有等位基因数在肿瘤组织身源鉴定中的应用

    在对消化系统常见的结直肠癌和胃癌组织中Identifiler系统D8S117915STR基因座的变异规律进行了研究,发现在这些肿瘤组织中,STR基因座的变异是一种常见现象,其变异类型包括出现新等位基因(Anew)、等位基因增加(Aadd)、完全杂合性丢失(LOH)和部分杂合性丢失(pLOH)4种类型。对于pLOH这种变异类型,虽然其检出率是最高的,但其对肿瘤组织身源鉴定的影响却是最小的,因为从定性角度看,这种变异并未导致样本基因型检测出现错误。相反.气,、AaddLOH这三种变异类型则可导致样本STR基因型出现改变(可统称为STR基因型改变,sT^):无论是结直肠癌患者还是胃癌患者,从个体水平看,均有超过30%的个体的种辔组织出现了STRGA变异。显然,面对如此高的个体水平上的STRGA变异硷出辜.通过似然率计算、采用常规的个体识别的标准进行消化系统肿瘤组织身源鉴定.其风险之高是无法为司法鉴定实践所接受的。在这种情况下,必须采用新的策略。

    共有基因座数与共有等位基因数二者密切相关,但所包含的遗传信息并不完全等同。事实土,国内外已有较多学者将共有基因座数和共有等位基因数作为重要参数应用于同胞关系鉴定的判别分析,这一方法的理论前提是:依据孟德尔遗传定律,孩子的全部遗传基因分别来源于其亲生父母双方,不同基因座上的基因在形成配子时自由组合,形成子代的基因型,子代的同一基因座上的两个等位基因,一个来自父亲,一个来自母亲。因此,全同胞间同一个基因座上的等位基因可能是完全相同、一半相同或完全不同。从概率统计的角度看,同胞间拥有较多数目的共有等位基因和全相同基因座数的倾向必然大于无关个体之间。

    受前述关于全同胞关系鉴定研究的启示,发现在以下两个基本假设的前提下,依据共有基因座数和共有等位基因数可能会为肿瘤组织身源鉴定提供一种可行方法:①被告无罪推定的基本法理,即在上述案件中均应先假设所涉肿瘤组织检材来自于案件中患者自身;②如果肿瘤组织不出现变异,若检测15STR基因座(如Identifiler系统),肿瘤组织与身源正常组织全相同基因座数为15,共有基因数为30,这类似于全同胞关系中的一种极端情形,即同卵双胞胎。随着肿瘤组织中突变基因座个数的增加,全相同基因座数和共有等位基因数将分别小于1530而趋近于无关个体间朐水平。

    在确认了肿瘤组织中共有基因座数和共有等位基因数的计算原则后,对基于共有基因座数和共有等位基因数的Fisher判别分析在消化系统肿瘤组织身源鉴定中的应用进行了可行性研究。

 

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